Como abrir, editar e converter arquivos PDB
Un ficheiro coa extensión de ficheiro PDB é probablemente un ficheiro creado no formato de Base de Datos do programa que se usa para almacenar información de depuración dun programa ou módulo, como un arquivo DLL ou EXE . Algunhas veces son chamados de símbolos.
Os ficheiros PDB numeran varios compoñentes e declaracións nun código fonte para o seu produto final compilado, o que o depurador pode usar para atopar o ficheiro de orixe e a localización no executábel no que debe deter o proceso de depuración.
Algúns ficheiros PDB poderían estar no formato de arquivo de Protein Data Bank. Estes arquivos PDB son ficheiros de texto simples que gardan coordenadas sobre estruturas proteicas.
Outros ficheiros PDB probablemente créanse na base de datos Palm ou o formato PalmDOC e úsanse co sistema operativo móbil PalmOS. Algúns ficheiros neste formato usan a extensión de ficheiro .PRC.
Como abrir un ficheiro PDB
Diferentes programas usan o seu propio ficheiro PDB para almacenar datos nun formato de base de datos estructurado, polo que cada aplicación utilízase para abrir o seu propio tipo de ficheiro PDB. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio e Pegasus son só algúns exemplos de programas que poden empregar un ficheiro PDB como ficheiro de base de datos. Radare e PDBparse poden funcionar tamén para abrir ficheiros PDB.
Algúns arquivos PDB almacénanse como texto sinxelo, como ficheiros de base de datos de Debian do programa de Geneious, e son completamente legibles por humanos se se abren nun editor de texto. Pode abrir este tipo de ficheiro PDB con calquera programa que poida ler documentos de texto, como o programa Notepad incorporado en Windows. Algúns outros lectores e editores de ficheiros PDB inclúen Notepad ++ e Brackets.
Outros ficheiros de bases de datos PDB non son documentos de texto e só son útiles cando se abren co programa para o que está destinado. Por exemplo, se o seu ficheiro PDB está relacionado de certa forma a Quicken, entón intente usar ese software para ver ou editar o ficheiro PDB. Visual Studio espera ver un ficheiro PDB na mesma carpeta que o arquivo DLL ou EXE.
Podes ver e editar arquivos PDB que son ficheiros de Protein Data Bank, en Windows, Linux e MacOS con Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB e USCF Chimera tamén poden abrir un ficheiro PDB. Xa que estes ficheiros son de texto simple, tamén pode abrir o ficheiro PDB nun editor de texto.
Palm Desktop debería poder abrir arquivos PDB que están no formato de ficheiro da base de datos de Palm, pero pode ter que renomealo por primeira vez para ter a extensión de ficheiro .PRC para que o recoñeza. Para abrir un ficheiro PDB de PalmDOC, proba o Visor de STDU.
Como converter un ficheiro PDB
Os ficheiros de base de datos do programa probablemente non se converterán a un formato de ficheiro diferente, polo menos non cunha ferramenta de conversión de ficheiros regular . No seu canto, se hai algunha ferramenta que poida converter este tipo de arquivo PDB, sería o mesmo programa que pode abrilo.
Por exemplo, se precisa converter o ficheiro de base de datos PDB de Quicken, proba usar ese programa para facelo. Este tipo de conversión, non obstante, probablemente non só sexa de pouca utilidade, pero tampouco é compatible con estas aplicacións de base de datos (é dicir, probablemente non necesite converter este tipo de ficheiro PDB a outro formato).
Os ficheiros de Protein Data Bank pódense converter a outros formatos con MeshLab. Para iso, pode ter que converter primeiro o ficheiro PDB a WRL con PyMOL desde o menú Ficheiro> Gardar imaxe como> VRML e despois importar o ficheiro WRL en MeshLab e usar o menú Ficheiro> Exportar malla como para converter o PDB en última instancia ficheiro a STL ou a outro formato de ficheiro.
Se non necesita que o modelo teña cor, pode exportar o ficheiro PDB directamente a STL con USCF Chimera (a ligazón de descarga está arriba). Se non, pode usar o mesmo método que o anterior (con MeshLab) para converter PDB a WRL con USCF Chimera e exportar o ficheiro WRL a STL con MeshLab.
Para converter PDB a PDF ou EPUB , se ten un ficheiro PalmDOC, é posible varias formas pero o máis sinxelo é usar un conversor PDB en liña como Zamzar . Pode cargar o ficheiro PDB a ese sitio web para ter a opción de convertela a estes formatos así como a AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT e outros formatos de ficheiros de libros electrónicos.
Para converter o ficheiro PDB ao formato FASTA pódese facer co conversor FASTA do PDB en liña de Meiler Lab.
Tamén se pode converter PDB a CIF (formato de información cristalográfica) en liña utilizando PDBx / mmCIF.
Lectura avanzada sobre ficheiros PDB
Podes ler moito máis sobre ficheiros de Base de Datos do Programa de Microsoft, GitHub e Wintellect.
Hai máis información sobre os ficheiros do Banco de datos de proteínas tamén; consulte Banco Mundial de Proteínas e RCSB PDB.
O teu ficheiro aínda non se abre?
Os ficheiros PDB que non se abren con ningunha das ferramentas de arriba, probablemente non sexan realmente arquivos PDB. O que podería estar ocorrendo é que está mal interpretando a extensión do ficheiro; algúns formatos de ficheiro usan un sufixo que se asemella moito a ".PDB" cando están realmente non relacionados e non funcionan do mesmo xeito.
Por exemplo, un ficheiro PDF é un ficheiro de documento, pero a maioría dos programas de arriba non renderán o texto nin as imaxes correctamente se tentar abrir un con estes programas. O mesmo é certo para outros ficheiros con extensións de ficheiros similares, como PD, PDE, PDC e PDO.
PBD é outro que pertence ao programa EaseUS Todo Backup e, polo tanto, só é útil cando se abriu con ese software.
Se non ten un ficheiro PDB, investigue a extensión de arquivo que ten o seu ficheiro para que poida atopar o programa axeitado que o abre ou o converte.